Прошло десять лет с тех пор, как разгорелся конфликт между планетой Набу и Торговой федерацией. Граф Дуку руководит сепаратистским движением, некоторые солнечные системы приняли решение перестать быть частью Галактической Республики. Из-за этого Республика все больше погрузла в хаосе и противоречиях. В Галактике мир весьма неустойчивый, и многие факты это усложняют. Совершается покушение на Падме – королеву Набу. Из-за этого канцлеру Палпатину приходит в голову, что неплохо было бы организовать ей охрану и двух джедаев для этого будет вполне достаточно. Охранять королеву поручают Энакину Скайуокеру и Оби-Вану Кеноби. Позднее происходит еще одна попытка убить королеву, тогда Энакин остаеться с ней, а Оби-Ван отправляется заниматься расследованием, чтобы узнать, кем организовываются эти покушения и как их прекратить. Чтобы защитить королеву, охранники сражаются с джедаями-отступниками, возглавляемыми графом Дуку.